Sauf étude béton (assez onéreuse) poussée et maçon qui la respecte scrupuleusement (plutôt rare), il est fortement déconseillé de faire des fondations à des altitudes différentes.
Après, vide sanitaire ou pas, il n'y a pas de raison technique.
Dans tous les cas, une dalle posée requiert un remblai préalable, compacté par couche de 20cm. Qu'il y en ai 20cm ou 1m, ça ne change que le nombre de couches.
Si c'est une dalle portée, quelle que soit la nature du vide en dessous, elle peut très bien être bien isolée, avec des hourdis polystyrène à languette, par exemple.

je me sens obligé de rectifier, là ! j'ai l'impression d'avoir voulu dire exactement le contraire : il est FORTEMENT DECONSEILLE de faire des fondations à des hauteurs différentes

Ma maison est construite sur des fondations de profondeur différentes.
Il y a 90m2 de sous-sol (murs banchés) et 90m2 de vide sanitaire. Le terrassier a fait 2 plateformes à une profondeur de 80/100cm pour le VS et à 250cm pour le sous-sol.
La liaison entre les 2 types de fondation est renforcée par des redans assez impressionnants. Le tout est recouvert par poutrelles/hourdis et dalle de compression.

Par contre j'ai fait une étude de sol (1300 euros) et ai fait appel à un bureau d'étude béton et charpente (étude BE 1200 euros). Le maçon à suivi à la lettre les indications du BE.

Je pense que si c'est bien fait c'est possible, mais il faut respecter les règles de l'art et surtout éviter le à peu près…