>>ce serait quand même con de passer à côté

ça se discute. Franchement si je construisais pour moi, la certif BBC serait quelque chose qui ne me pourrirait pas la vie bien longtemps. Actuellement, pour un projet avec poêle à bois, il faut passer en commission Titre V (dérogation parce que pas de chauffage central), n'utiliser que des matériaux certifiés, sous avis technique (sauf encore dérogation pour les auto-constructeurs, mais pas gagné) et mettre en oeuvre des techniques et solutions quantifiables par les règles de calculs de la RT… bref une série de limitations qui orientent violemment les choix de conception vers des solutions pas forcément efficaces, pas forcément bon marché, pas forcément économiques (réellement) à l'usage, mais prises en compte par une réglementation thermique obsolète.
A la clé, il n'y a sûrement pas 20 k€ à récupérer, à mon avis moins de la moitié passé partout (et je suis large). La véritable plus-value pour le bâtiment, ce ne sera pas, dans 10 ans, la certif BBC de 2010 (quelle rigolade) qui ne garantit aujourd'hui en rien une consommation faible (rappelons le quand même) mais bien le retour d'expérience et les factures d'énergie. (bcp plus parlant)
Pour en revenir au chauffage : c'est un détail. Ce n'est même pas le premier poste de dépense énergétique en principe (c'est l'ECS).
Donc autant se poser les bonnes questions : chercher à construire à bas coût pour récupérer le crédit d'impôt, c'est facile (construction conventionnelle parpaing+PAC pour chauffage et eau chaude+VMC DF voire hygro B dans certaines régions). Mais clairement, il faut revendre vite dès qu'on a touché les sous pour construire quelque chose de sérieux